PPP模式设计是项目操作的关键，模式设计一般包括六个方面。
一是交易结构，股东各方的逻辑关系，政府给予授权、补贴、采购的操作方式，企业参与投资、运营、回款和移交的标准、时间以及回报；
二是股权结构，政府方是否参与，参与形式、股权比例及股东权益；
三是融资结构，又叫债权结构，包括银行贷款、基金、信托等渠道，以及资金成本和增信要求；
四是收益结构，就收益而言，要明确投资回款来源和方式，一般有政府财政采购、财政补贴、使用者付费等几大类，地方财政从以往的“补建设”逐步转向“补运营”；项目收益的类型和形式多种多样，它表现项目服务及收益特征，也体现投资人的综合能力；
五是风险分担结构，它的基本原则应该是通过评估风险防控能力、受益大小、控制风险的代价等情况，合理分配参与各方的风险；六是项目公司治理结构，参与各方权责界定，及在股东会、董事会、经营层的人员配置。
上述PPP的模式设计，都需要通过投资项目的协议、合同、章程来约定，越明确越好。